攜手偉薩、研華及英特爾 GARAOTUS助印度醫療機構提升疾病研究效能89%

圖1:GARAOTUS攜手偉薩科技、研華科技及英特爾,提供印度醫療機構MedGenome基因組分析整體解決方案,大幅提昇其在罕見疾病及帕金森氏症89%的運算效能。 

【2022年7月26日,台北訊】精誠集團旗下高速運算(High Performance Computing, HPC) 品牌GARAOTUS,基於彈性且高效的運算能力所設計出的基因組分析解決方案,協助印度MedGenome醫療機構,大幅提昇MedGenome在罕見疾病和帕金森氏症,以及其他領域的研究所需的運算能力,共同為生醫研究領域做出貢獻。

GARAOTUS攜手偉薩科技、研華科技及英特爾,提供印度醫療機構MedGenome基因組分析整體解決方案。該解決方案整合了GARAOTUS自行研發HPC平台,CRONUS Service Fabric及CRONUS Orchestration,並搭配研華科技提供的高效能及穩定的硬體架構,以及偉薩科技提供的程式化邏輯閘陣列FPGA(Field Programmable Gate Array)結合基因定序分析的加速解決方案,有效協助MedGenome提升疾病研究效能達89%!

MedGenome是一家總部位於美國德拉瓦州的印度醫療機構,並在 2018 年獲得了生物醫學突破獎(MedTech Breakthrough Award),其生物資訊學副總裁Ravi Gupta表示:「我們的醫生和研究人員對該解決方案展現的效能及成本比印象深刻,這個解決方案為MedGenome提供並擴大了在罕見疾病和帕金森氏症,以及其他領域研究所需的運算能力。」GARAOTUS提供的基因組分析解決方案,能有效將100人的全基因組定序(Whole genome sequencing, WGS)研究時間縮短到三分之一。

隨著人體基因分析、疫苗及新藥的開發應用越來越多且複雜,研究人員需要處理與分析的流程及數據量更是多樣及多元。在缺乏視覺化、模組化與整合性的資料分析處理下.將面臨多種在資料導入及整合上的困境,更無法有效推動研究的進行。為協助解決此一難題,GARAOTUS提供的CRONUS平台,讓研究人員不須編寫程式,就可以運用視覺化介面以拖拉方式輕鬆進行資料分析及資訊儲存。同時,資料也能夠在組織間輕鬆的交換及協作,透過統一的平台及彈性的權限設計,讓整體流程及研究成果更易於管理,也方便研究成果重現及再利用,藉此讓非IT程式背景的研究人員,降低研究門檻,更能靈活運用研究資訊。

GARAOTUS團隊負責人薛聖傑指出:「研究統計中發現,企業或機構在建置HPC技術時,有將近七成的時間都花在軟硬體的校對調整,相對的,研究人員只有三成的時間能放在核心業務。GARAOTUS平台服務的最大優勢在於,能協助完備機構所需的HPC整體系統架構建置,在介面上也降低程式指令的困難度,並轉化為視覺化的圖像。GARAOTUS在成立初期,即鎖定朝向國際發展,從過去落地台灣大型教學醫院,再來協助香港中文大學進行基因定序研究,很開心CRONUS產品也能在印度新興市場落地,為MedGenome提供HPC相關解決方案,未來GARAOTUS也將持續與國際生態圈夥伴合作,共同發展更多成功案例。」

CRONUS的平台優勢包括採用了HPC技術的底層架構,並向上延伸到服務層,提供了GAPaaS (Genomics-Analytics-Process-as-a-Service)的視覺化服務,未來GARAOTUS將持續攜手各領域生態圈夥伴提供服務,包括過去投入的精準醫療與大氣服務,下個階段更將著眼助攻半導體晶片的研發製程、全自動智慧製造應用,以及金融高性能計算的數值方法應用等,助力各產業與高速運算技術接軌。

GARAOTUS今(2022)年更獲得美國全球企業領袖雜誌(Global Business Leaders Magazine),評選為全球矚目的30大企業之一。報導指出,GARAOTUS 提供了具備多樣化與包容性的HPC解決方案,並涵蓋了許多開源技術的應用。多年來,團隊在開源組織社群發揮舉足輕重的作用,也曾經在2021年獲頒亞洲企業組織(Enterprise Asia)的IIA國際創新獎,是第一個因HPC 技術獲得此獎項的團隊。未來團隊將持續以HPC技術為基礎,擴展解決方案組合,建構各行業應用平台層,讓各產業能無縫對接HPC所提供的「算力」,加速實現數位轉型。

圖2:GARAOTUS獲美國全球企業領袖雜誌評選「2022全球前30大矚目企業」之一