全方位的垂直整合架構及基因分析服務
精誠GARAOTUS加速推動Cloud HPC應用
精誠雲服務品牌GARAOTUS,憑藉在HPC高速運算架構累積十多年以上經驗及垂直整合能力,提供從底層平台到上層服務的整體解決方案,加速推動HPC應用腳步。
【2021年10月28日,數位時代】科技與網路的進步,帶來龐大數據量,越來越多產業需要快速處理大量資料,這股新興需求推動高效能運算(HPC)的市場發展,讓HPC應用範圍越來越廣,從早期的政府或科學研究(如:大氣、天文、化學等)領域,逐漸走入包括高科技製造、金融、醫療業各個產業,成為未來10年的重點科技趨勢。
HPC應用二大挑戰
無論哪一種產業或應用模式,在打造HPC環境時,通常會遇到二大挑戰,一是如何做到HPC效能最大化,二是跨領域整合。
精誠雲服務品牌GARAOTUS團隊負責人薛聖傑表示,一般電腦或伺服器在運作軟體或處理資料時,比較不需要考量硬體效能,只要硬體規格夠用就好,但HPC不同,其需要一個專業團隊進行整體評估,才能讓硬體效能發揮到最大、最高,因為運算效能即便只差距1%,最終運算結果的產出時間可能就會差距數倍以上,相對產業競爭力、甚至國力就會受到影響。
然而,要「榨乾」HPC的硬體效能並不容易,必須考量到許多因素,薛聖傑以自身完成3座TOP 500(全球前500大高速計算主機)的建置經驗指出,首先要將伺服器、網路設備、儲存設備等硬體效能調到最大,再安裝要運行的系統或程式,然後再次調整軟硬體的參數設定,使其能夠相互配合、發揮最大效能,「這是相當複雜的過程,不是所有設定都調到最大值就好,必須靠經驗和反覆測試,才能找出每一個參數的最佳設定值,使HPC發揮最大效能,」薛聖傑強調。
至於第二個挑戰:跨領域整合。不只是IT硬體到軟體的整合,還有研究人員自身專業領域與IT專業的整合。
在啟動研究專案時,研究人員得先計算/校調需要的硬體資源,因此需要具備IT專業知識,才知道該如何建置HPC基礎運算環境,但多數研究人員不具IT專業,只有少部分資深研究者具備跨領域知識,反應在實際執行上,就是會占用掉研究者很多時間。根據統計,研究專案中高達60-70%的時間用在進行硬體校調,研究人員只有30%時間可以放在核心業務上,由此可知,對於研究者來說,硬體校調並不是一件容易的事。
以HPC架構為基礎發展完整雲服務
為了克服HPC應用的兩大挑戰,加速其發展腳步,GARAOTUS以HPC高速運算架構為基礎,向上發展出整合式雲服務,提供從IaaS、PaaS到SaaS的整體解決方案,既可提高運算效能,又能透過簡易的操作介面、降低產業使用者的進入門檻,相較於其他Cloud HPC業者而言,GARAOTUS不只更具成本效益,在系統參數設定上也更具彈性。
薛聖傑說明,這是因為GARAOTUS在HPC領域已經累積十多年以上的建置經驗,且團隊成員來自各種不同專業領域,包括雲平台規劃與建置、HPC底層架構等,不只具備垂直整合能力,還將整合能力延伸到應用端,納入基因醫療、大氣科學等專家,提供服務,透過豐富經驗與多元人才,打造出高效能且涵蓋底層到上層的全方位服務。
尤其GARAOTUS的兩大SaaS服務可以根據資料類型和規模,自動決定需要的硬體資源和參數,研究人員只要餵入程式和數據、再調整屬於自身研究領域的系統參數就可以,省去自行校調硬體的作業,相對可以讓一些新進或不太瞭解IT的研究人員,也能輕鬆進行研究專案,大幅降低產業使用者的進入門檻,例如之前協助工研院建置材料化學雲,讓中小企業也能用租賃的方式使用模擬軟體,讓規模不大的企業,也能享受HPC雲運算的優勢,並且大幅節省了自建雲的成本支出。
又如香港中文大學生命科學相關的基因分析研究團隊,亦是在整體性考量下,決定導入GARAOTUS雲服務-基因分析解決方案(Genomics Analytics as a Service;GAaaS),希望能加速基因分析研究,研發更多疾病預防與創新治療的方式。
GARAOTUS團隊負責人薛聖傑表示,GARAOTUS憑藉在HPC領域累積十多年以上的建置經驗、涵蓋各領域的專業人才、及垂直整合能力,打造出高效能且涵蓋底層到上層的全方位服務。
薛聖傑分享,當初參與評選的業者共有十多家,香港中文大學基於以下兩點因素而決定與GARAOTUS合作,一來因為在底層硬體規劃上,GARAOTUS提供了完整的框架設計,讓香港中文大學在打造出私有雲HPC機房時更有彈性,可以選擇想要的硬體廠牌和設備,二來在上層應用端,藉由GARAOTUS Cloud Platform簡易的操作介面,研究人員也能減少技術負擔,專心於議題研究,加速產出研究成果。
目前,GARAOTUS在SaaS層面的雲服務應用主要聚焦兩大領域,除了上述提及的基因分析解決方案,另外一項則是大氣服務(Atmosphere as a Service)。未來還會持續與其他業者合作,在HPC架構的基礎上,發展不同專業領域的SaaS雲服務,同時也會和台灣與亞太區IDC廠商合作,將SaaS雲服務放在公有雲環境裡,打造完整的GARAOTUS服務生態圈。
在發展SaaS服務應用之餘,GARAOTUS也會針對基因醫療應用積極培育跨領域人才,像是與國內外優秀的基因醫療團隊合作,或是推動校園產學合作計劃,藉由在學校開設產學合作專班、捐贈研究設備等方式,讓研究生在校時就能建立HPC跨領域整合能力,並產出更多創新研發成果,而GARAOTUS則能藉由學校師生的使用經驗去優化SaaS服務,GARAOTUS的團隊也會將多年團隊在業界的開發成果以及技術,傳承給台灣的學子。此外,GARAOTUS未來也會積極開拓國際市場,從亞太區到歐美全力搶攻全球HPC商機,為此,每年GARAOTUS都會舉在HPC高峰會,今年的HPC亞太開峰會將在十一月十八日於線上隆重舉行。